آیت‌الله جواد محقق یزدی به دلیل اظهارات جنجالی خود نسبت به رهبر ایران و انتقادات از سیاست‌های حاکمیتی، با حکم دادگاه ویژه روحانیت بازداشت شد.
گفته می شود در پی اظهارات جواد محقق یزدی که به رهبر ایران گفته بود در صورتی که چهار پسر خود را به غزه و لبنان اعزام کنی من هم تا کاخ سفید خواهم رفت، وی با حکم دادگاه ویژه دستگیر شد.
این گونه رخدادها نشان‌دهنده ادامه روند سرکوب روحانیون و مراجع تقلید مستقل در ایران است.
طی سال های اخیر برخی از مراجع تقلید و روحانیون منتقد هم چون محمدتقی اکبرنژاد و محسن برهانی نیز دستگیر شده‌اند.
این وضعیت حاکی از فشارهای مستمر بر روحانیون منتقد است و پرسش‌هایی درباره آزادی بیان و حقوق روحانیون منتقد در جامعه ایران را به وجود می‌آورد.
